補助金で落ちる理由は、たいてい「対象外だった」です。
京都では、もうひとつ多い理由があります。
順番を間違えた、というものです。
福知山市には有機JASとGAP、2つの認証の補助があります。
⚠️⚠️有機JASは「認証を取る前」に申請し、GAPは「取ったあと」に申請します。同じ市の、似た制度なのに、順番が逆です。
京都はほかにも入口が独特です。
⚠️府の高温対策は3月中旬に締め切ります——年度が始まる前です。
⚠️府のスマート農業は窓口が府ではなく市町村。
⚠️亀岡市の堆肥は個人では申請できず、農家組合が出します。
⚠️福知山市の販路開拓にいたっては「農業経営の講座を受講したことがある人」でないと申請できません。
制度が合うかどうかより先に、いつ・どこへ・誰が出すのかを確かめる県だと考えてください。
この記事では掲載14件を出し手ごとに金額つきで整理します。
一覧で見たい方は京都府の補助金一覧からどうぞ。
京都の内訳
⚠️ この件数は当サイトの調査状況を反映した数字です。
京都府には26の市町村があり、表に出ていない市町村にも制度がある可能性は十分あります。
件数の順位を「手厚さの順位」と読まないでください。
🥇⚠️⚠️同じ市で、申請の順番が逆になっている
福知山市 有機JAS認証新規取得支援事業補助金は、⚠️「認証を取得する前」に市へ交付申請書を出し、交付決定通知を受けてから認証を取る流れです。
先に認証を取ってしまうと使えません。対象経費の1/2以内・上限4万円で、⚠️新規取得のみ（更新は対象外）。
福知山市 国際水準GAP認証取得支援事業補助金は逆です。
⚠️「認証を取得した年度の末日まで」に申請する後払い方式で、上限10万円。
⚠️⚠️ 有機JASは先に申請、GAPは取ってから申請。順番を取り違えるとどちらも使えなくなります。⚠️GAPのほうは公式ページに補助率の記載がないので、全額なのか一部なのかは申請前に農業振興課へ確認してください。
⚠️法人・団体は福知山市内に本社・支社・支店・営業所等があることが条件です。
⚠️GAPは年度をまたぐと使えなくなるので、認証が取れたらすぐ動いてください。
⭐亀岡市は「更新」も見てくれる
亀岡市 有機JAS認証取得支援事業補助金は、⭐継続取得（更新）も対象です。
有機JASは毎年の更新費用がかかるので、ここが対象なのは大きい。補助率は申請回数で変わり、⭐1度目は10分の7、2度目は10分の6、3度目は10分の5（上限10万円・⚠️通算3回まで）。
⚠️
振込手数料・郵送料・申請書式集代・認証機関の年会費・認証シール発行費用は対象外で、
認証機関に
払う
申請料と
現地検査料が
中心に
なります。
⚠️市税の
滞納が
あると
対象外で、
申請には
市役所1階税務課で
取る
「完納証明書」（発行手数料あり）が
必要です。
⚠️予算上限に
達し次第終了する
ため、
年度前半に
動く
ほうが
確実です。
💡新規取得の
人は
有機JAS講習会の
受講料も
対象に
なります。
有機の
制度
全般は
有機・自然栽培で就農するときの補助金も
どうぞ。
GAPのほうは久御山町 GAP認証取得及び維持支援補助金が1/2以内で、上限は経営体100万円／3戸以上の販売農家団体所属で60万円。
⭐新規取得だけでなく維持審査も対象です（⚠️審査員の交通費・宿泊費は除く）。
認証の補助が府内に4件あるのは、宇治茶や京野菜のように「名前で売る」産地を抱えているからでしょう。
🥈府の3件は、入口がそれぞれ違う
⚠️⚠️京都府 農業経営基盤強化（高温対策等）事業は、募集が例年3月上旬〜中旬（令和8年度は3月9日〜3月19日）。
年度が始まる前に締め切られます。
いずれも1/2以内（消費税対象外）。
⚠️対象は認定農業者・認定新規就農者・農地所有適格法人、または3戸以上の販売農家団体に所属する販売農家です。
夏の暑さで困ってから動くと、次の募集は翌年の3月になります。
京都府 スマート農林水産業実装チャレンジ事業補助金は、✅認定農業者等の「個別経営体」として個人単独で申請できます（3/10以内・上限400万円）。
⭐3戸以上の団体だと補助率が上がり（土地利用型作物5/10以内、その他作物や畜産林業水産4/10以内）、 ⭐中山間地域の団体は4.5/10以内と平場より優遇されています。
⚠️ 申請窓口は府ではなく、事業所のある市町村です。⚠️下限事業費は30万円以上（小さな導入では使えません）、 ⚠️通信費は対象外（初期導入費のみ）。
⚠️3年後に生産額1割以上の増加、または2割以上のコスト削減を実現する計画が必要で、 ⚠️導入後7年間は経営規模を維持する必要があります。
自動運転トラクター・ドローン・センシングシステム・搾乳ロボット・自動給餌システムなどが対象です。
京都府 農企業者経営力強化事業は補助率30%以内で、上限が経営規模タイプ別（新規就農タイプ150万円／2千万・5千万タイプ2,000万円／1億円以上タイプ3,000万円）。
⚠️民間金融機関からの融資確保（50%以上等）と、常時雇用の確保（新規雇用を含む）が条件なので、借入と雇用をセットで組める段階の経営体向けです。
🥉個人では出せないもの、認定がなくても出せるもの
⚠️⚠️亀岡市 安全・安心のエコ農業推進事業は堆肥の購入費用の10分の3が戻る制度ですが、個人で直接は申請できません。農家組合などの営農集団組織が実施主体になって散布計画をまとめて申請する方式なので、まず所属している農家組合に相談してください。
⚠️ 対象になる堆肥は銘柄が指定されています（さくら有機・がんばる有機・犬甘野堆肥・南桑有機・発酵鶏糞）。
市外の堆肥は対象外です。
⚠️1人・農地10アールあたり購入経費6,000円以上の堆肥を入れることが目安の条件、 ⚠️締切は例年6月末（令和8年度は6月30日）と早め、 ⚠️申請額の合計が予算を超えると調整され満額が出ない場合があります。
💡運搬・散布経費も購入経費に含めて計算できます。
逆に⭐京丹後市 小規模農業者支援事業補助金は、認定農業者でなくても営農の意思・ビジョンがあれば対象になります。
1品20万円以上の農業用機械・設備の購入が1/3以内・上限30万円。
認定を持たない小規模層の受け皿です（⚠️令和8年度の締切は5月29日）。
京丹後市 果樹農家営農推進支援事業は果樹の新植10アール以上（規模拡大・農地継承）が条件で、果樹棚と乗用型防除機が各上限100万円（1/2以内）、肥料・農薬・苗木・資材・リース料・農地賃借料・施設整備は上限50万円（⚠️こちらも令和8年度は5月29日締切）。
久御山町 スマート農林水産業実装チャレンジ事業はスマート技術の導入経費が農協等5/10以内・個別経営体3/10以内。
南丹市 農業振興事業補助金はメニュー型で、がんばる農業応援事業が4〜5/10以内・上限150万円、 ⭐パイプハウス整備が1/4〜4/5以内、土づくりが堆肥2,000円/トン・液肥800円/トン以内、耕作放棄地解消が5万円/10アール以内または1/2、 ⭐土地改良・農道舗装まで5/10以内と幅広く揃っています（⚠️メニューごとに対象者・要件が異なるので、まず市農林商工部へ）。
売り方を変えるなら、先に講座を受けておく
福知山市 農業者販路開拓事業補助金は対象経費の1/2以内・上限25万円。
ホームページ・チラシ・パンフレットの作成費、商談会への出展費が対象で、 ⭐Eコマース・移動販売・テイクアウト・宅配サービスの導入といった「新たな販売手法」も対象です。
⚠️⚠️ 「農業経営に係る講座を受講したことがある方」が条件です。受講歴がないと申請できないので、まず市に受講できる講座を確認してください。⚠️対象は「新たに実施する取組」に限られ、すでにやっていることの継続費用は対象外です。
⚠️交付決定通知が届いてから発注してください（先に発注すると対象外）。
⚠️汎用性の高い物品（パソコン・コピー機・自動車）や、調理器具・什器・冷蔵庫といった一般に備えるべき物品は対象外、⚠️中古品も対象外です。
💡事業完了前の概算払も相談できます。
小さい制度もあります。
⭐亀岡市 土壌診断補助金は1つの農地につき3,000円が上限（補助率1/2）で、同一年度に5農地まで＝最大15,000円。
金額は小さいものの、肥料代の見直しや有機質肥料への転換を考えるときの入口になります。
⚠️申請には「土壌診断結果のコピー」「領収書」「農地の場所が分かるもの」が必要なので、診断結果は必ず保管してください。⚠️市税の完納証明書も要ります。
京都で申請するときの注意点
- ⚠️⚠️認証は「前」か「後」かを先に確かめる。福知山市は有機JASが取得前、GAPが取得後。
同じ市でも逆なので、制度ごとに確認してください - ⚠️⚠️年度が始まる前に閉まるものがある。府の高温対策は例年3月上旬〜中旬が締切です。
夏に困ってから動くと、次は翌年3月になります - ⚠️窓口が府とは限らない。府のスマート農林水産業実装チャレンジは申請先が事業所のある市町村です
- ⚠️個人で出せないものがある。亀岡市の堆肥は農家組合等が実施主体で、個人が直接申請することはできません
- ⚠️先に条件を満たしておく必要がある制度がある。福知山市の販路開拓は「農業経営に係る講座の受講歴」、府の農企業者経営力強化は融資の確保と常時雇用が入口条件です
- 🔴交付決定の前に発注しない。福知山市の販路開拓、府の各事業とも、決定前に契約すると対象外になります
- 💡締切が5月末に固まっている市がある。京丹後市は果樹も小規模機械も令和8年度は5月29日締切でした。
年度当初に市のページを確認する習慣をつけてください
まとめ：京都は「順番」と「窓口」から確かめる
- 有機JASを新しく取る＝福知山市（1/2・4万円。
⚠️⚠️取得「前」に申請）／⭐亀岡市（1度目7/10・上限10万円） - 有機JASを更新する＝⭐亀岡市（⭐更新も対象・⚠️通算3回まで）
- GAPを取る＝福知山市（上限10万円。
⚠️⚠️取得「後」に申請）／久御山町（1/2・経営体100万円・⭐維持審査も対象） - 暑さ対策をする＝⚠️⚠️府の高温対策（園芸100万／水稲250万／宇治茶100万。
締切は3月中旬） - スマート機械を入れる＝府（個人3/10・上限400万。
⭐団体なら5/10・⭐中山間4.5/10。
⚠️窓口は市町村）／久御山町（農協5/10） - 認定なしで機械を買う＝⭐京丹後市（1/3・30万円。
⚠️1品20万円以上） - 果樹を新植する＝京丹後市（棚・防除機各100万円。
⚠️10a以上・5月末締切） - ハウスを建てる・直す＝⭐南丹市（パイプハウス1/4〜4/5以内）
- 農道や土地改良をする＝⭐南丹市（5/10以内）
- 堆肥を入れる＝亀岡市（3/10。
⚠️⚠️農家組合経由・⚠️銘柄指定・6月末締切） - 土壌を調べる＝⭐亀岡市（1農地3,000円・年5農地まで）
- 売り方を変える＝福知山市（1/2・25万円。
⚠️⚠️講座の受講歴が条件） - 借入と雇用をセットで拡大する＝府の農企業者経営力強化（30%・最大3,000万円。
⚠️融資確保と常時雇用が条件）
有機・環境の制度は有機農業・環境保全の補助金、スマート農業の制度はスマート農業・農業機械の補助金もあわせてどうぞ。
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